فایل ورد کامل Arlequin (ورژن ۳): یک بسته نرم افزاری مجتمع برای آنالیز داده های علم ژنتیک جمعیت

توجه : به همراه فایل word این محصول فایل پاورپوینت (PowerPoint) و اسلاید های آن به صورت هدیه ارائه خواهد شد

این مقاله، ترجمه شده یک مقاله مرجع و معتبر انگلیسی می باشد که به صورت بسیار عالی توسط متخصصین این رشته ترجمه شده است و به صورت فایل ورد (microsoft word) ارائه می گردد

متن داخلی مقاله بسیار عالی، پر محتوا و قابل درک می باشد و شما از استفاده ی آن بسیار لذت خواهید برد. ما عالی بودن این مقاله را تضمین می کنیم

فایل ورد این مقاله بسیار خوب تایپ شده و قابل کپی و ویرایش می باشد و تنظیمات آن نیز به صورت عالی انجام شده است؛ به همراه فایل ورد این مقاله یک فایل پاور پوینت نیز به شما ارئه خواهد شد که دارای یک قالب بسیار زیبا و تنظیمات نمایشی متعدد می باشد

توجه : در صورت مشاهده بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل می باشد و در فایل اصلی فایل ورد کامل Arlequin (ورژن ۳): یک بسته نرم افزاری مجتمع برای آنالیز داده های علم ژنتیک جمعیت،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد

تعداد صفحات این فایل: ۶ صفحه

ویژگی های جدید در Arlequin 3
• نسخه ۳ Arlequin رویه های هسته ای محاسباتی و رابط در یک برنامه واحد نوشته شده در C برای محیط ویندوز را ترکیب می کند. رابط برای فراهم کردن کارایی بالاتر به صورت کامل مجددا طراحی شده است.
• ترکیب دو روش جدید برای برآورد فاز گامتی و فراوانی های هاپلوتیپ:
الگوریتم ELB یک رویکرد Bayesian کاذب با هدف احیاء فاز گامتی ژنوتیپ های مولتی لوکوس است و برآورد فراوانی های هاپلوتیپ نتیجه فرعی این فرایند است. آپدیت های فاز برمبنای یک پنجره از مکان های ژنی مجاور ساخته شده و اندازه پنجره بسته به سطح مکانی عدم تعادل لینکاژی متفاوت است.
الگوریتم زیپ EM که تعمیمی از الگوریتم EM برای برآورد فراوانی های هاپلوتیپ هست هدف آن برآورد ژنوتیپ های مولتی لوکوس فازبندی نشده است. برآورد فازهای گامتی نتیجه فرعی این فرایند هستند. این الگوریتم بوسیله افزودن مکان ژنی به صورت تک تک عمل می کند و به تدریج طول هاپلوتیپ های بازسازی شده را توسعه می دهد.

عنوان انگلیسی:Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis~~en~~

New features in Arlequin 3

• Version 3 of Arlequin integrates the core computational routines and the interface in a single program written in C++ for the Windows environment. The interface has been entirely redesigned to provide better usability. • Incorporation of two new methods to estimate gametic phase and haplotype frequencies: The ELB algorithm (Excoffi er et al. 2003) is a pseudo-Bayesian approach aiming at reconstructing the gametic phase of multi-locus genotypes, and the estimation of the haplotype frequencies are a by-product of this process. Phase updates are made on the basis of a window of neighbouring loci, and the window size varies according to the local level of linkage disequilibrium.

$$en!!